Debuta en la dirección cinematográfica con "Enfrentados", cuyo guión también ha escrito de forma conjunta con Abby Everett Jaques.
La labor de Von Ancken como director recibió muchos reconocimientos con su primer cortometraje, Bullet in the Brain (2001), basado en el relato de Tobias Wolff sobre un amargado profesor universitario de literatura y sus pensamientos justo antes de morir después de haber recibido un disparo durante un atraco a un banco. Protagonizado por Tom Noonan, Bullet in the Brain fue seleccionado en más de 30 festivales y galardonado con el premio al mejor cortometraje en 10 de ellos.
Von Ancken ha dirigido varios episodios de algunas de las series de televisión más importantes del momento, como Numb3rs, CSI: NY, The Shield, Caso abierto, Sin rastro, Oz y The Jury, entre otras.