Nació en Londres y se educó en la London University, donde estudió Empresariales.
Thwaites empezó su carrera en la industria del entretenimiento como actor infantil, apareciendo en la serie de televisión de la BBC, "Las Crónicas de Narnia", basada en la serie de libros infantiles de C.S. Lewis.
En 2000, Thwaites se mudó a Los Ángeles donde empezó a trabajar como asistente de Mike Medavoy, fundador y presidente de Phoenix Pictures. Ahora es un ejecutivo de la compañía involucrado activamente en el desarrollo de muchos de los proyectos de Phoenix. También es productor de Miss Potter y productor ejecutivo de License to Wed.