Hermano menor de Keenen Ivory, Damon y Shawn Wayans, Marlon Wayans se gradúa en la escuela de Arte Dramático de Nueva York y paralelamente estudia cine en la Universidad de Howard. En 1988, aparece como figurante en ‘I'm Gonna Git You Sucka’, dirigida por Keenen Ivory Wayans.
Pronto Marlon se convierte en uno de los cómicos mñas influyentes de su generación, por lo que teme encasillarse en las comedias. Pese a ello, Darren Aronofsky le da la oportunidad de revelar su talento como actor en ‘Requiem por un sueño’ (2001), junto a Jared Leto.
Sin embargo, Marlon Wayans se da a conocer a nivel internacional tras protagonizar ‘Scary Movie’ y ‘Scary Movie 2’, paraodias de varias películas de terror. Antes de volver a trabajar con sus hermanos en la comedia ‘Dos rubias de pelo en pecho’ (2004) y ‘Pequeño pero matón’ (2006), se pone a las órdenes de los hermanos Coen en ‘Ladykillers’ (2003). En 2009, protagoniza ‘Dance Movie – Despatarre en la pista’ y ‘G.I. Joe’.