Nacido en Tokio en 1962, Kore-eda se licenció en Literatura en la Universidad de Waseda en 1987. Empezó a trabajar con el equipo de TV Man Union, una empresa independiente de producción para televisión donde realizó numerosos documentales, entre los cuales destacaremos Shikashi, sobre el suicidio de un alto funcionario del Ministerio de Medioambiente encargado de los expedientes de las víctimas de la enfermedad de Minamata; Otra educación, sobre una clase única en medio del campo cuya enseñanza se basa en la crianza de un ternero. También dirigió Agosto sin él, un documental sobre el primer japonés que declaró públicamente tener sida, y Sin memoria, el retrato de un hombre con pérdidas de memoria.
Ha producido los largometrajes de dos jóvenes realizadores japoneses: Kakuto, de Yusuke Iseya, que fue presentado en el Festival de Rotterdam 2003, y Frutos salvajes, escrito y dirigido por Miwa Nishikawa, presentado en el marco del Festival New Directors/New Films de Nueva York en 2003.