Peter Webber asistió a la escuela de cine en la Universidad de Bristol.
Webber dirigió documentales premiados sobre temas que abarcan desde el compositor Richard Wagner, pasando por los maniquíes para pruebas de choque, hasta las criaturas de los mares profundos. Más adelante, pasó a dirigir la controvertida miniserie de Channel Four titulada Men Only, que muestra el descenso al delito y la corrupción de los antes respetables miembros de un equipo de fútbol-sala. En The Stretford Wives para la BBC, presentó a Fay Ripley en la historia de una revancha femenina contra los hombres, antes de que se le invitara a dirigir el episodio número 6 de la serie A dos metros bajo tierra.
El largometraje con el que Webber debutó en la gran pantalla fue La joven de la perla, que protagonizaron Colin Firth y Scarlett Johannsen. Tuvo un enorme éxito, ganó cinco nominaciones a los premios de la Academia, dos nominaciones a los Globos de Oro y 10 nominaciones a los premios BAFTA.