Ballhaus ha sido director de fotografía de las películas de Alan Rudolph, La vida secreta de un dentista (The Secret Lives of Dentists) e Investigating Sex, así como el éxito alemán de Robert, Las joyas de la familia (Eierdiebe). También fue el director de fotografía de la última temporada de la serie de gran éxito de la HBO Sexo en Nueva York (Sex and the City) y en un gran número de películas en su país natal, Alemania.

Hijo del director de fotografía nominado al Oscar®, Michael Ballhaus, Florian Ballhaus comenzó su carrera como asistente de cámara, escalando posiciones hasta convertirse en operador de cámara.