Es conocido por su filmografía independiente. Antes de "Slacker", una película experimental que abarca un periodo de aproximadamente 24 horas en las vidas de 100 personajes y que fue muy aclamada en 1991, Linklater ya había rodado varios cortometrajes y una película en Súper 8 en 1988 "It s Impossible to Learn to Plow by Reading Books."
Linklater también trabaja como director artístico para la sociedad Austin Film Society que él mismo creó en 1985 para exponer películas de todo el mundo que normalmente no se proyectan en Austin. La Austin Film Society proyecta más de 100 películas al año y ha repartido 550,000 $ en subvenciones entre diversos cineastas tejanos. En 1999, la Austin Film Society recibió el primer premio National Honoree de la organización Directors Guild of America como reconocimiento por su trabajo de apoyo en favor de las artes.
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