Esta cinta supone un gran reto para el equipo de guionistas que tienen que conseguir que todo tenga sentido, principalmente, los problemas provienen de que el cómic Civil War fue escrito en 2006 y 2007, cuando aún no existía en Universo Cinemático de Marvel, por lo que hay que darle un sentido dentro de todo el mundo creador a posteriori en el cine. Especialmente, conseguir que tanto Robert Downey Jr. como Chris Evans, sean capaces de intepretar todos los matices del cómic, sin perder la esencia de ellos mismos.
Uno de estos retos es el de mantener al polémico Tony Stark como un personaje bueno, y no un villano como los últimos rumores y teorías fan apuntan que acabará siendo.