X-Men como metáfora de la homosexualidad
Algunos espectadores se dieron cuenta de que la situación por la que pasan los mutantes de la película es muy similar a la de los homosexuales, ya que muchos sufren desigualdad. El actor Ian McKellen, quien además de interpretar a Magneto es abiertamente gay, ha declarado que "los mutantes, al igual que los gays, son expulsados de la sociedad sin una buena razón" y Magneto y el Profesor Xavier son dos buenos ejemplos de la lucha por los derechos. El profesor Xavier quiere la integración, mientras que Magneto llega a utilizar la violencia para sus propios derechos".