14 años después del catastrófico Tercer Impacto, dos naves Evangelion pilotadas por Asuka y Mari se internan en el espacio con la misión de recuperar un contenedor que se encuentra en órbita sobre la Tierra y que contiene la llamada "unidad 01", de vital importancia. Cuando están a punto de hacerse con él, el dúo es atacado por la Nemesis Series, un grupo de drones orgánicos con muy malas intenciones. Asuka y Mari tratarán de repeler como puedan el ataque, pero de pronto un dron surje del propio contenedor que quieren conseguir, y todo se descontrola.
Tercera entrega de la saga 'Rebuild of the Evangelion', basada en el manga y anime 'Neon Genesis Evangelion'.
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