En el año 2099, la Tierra se encuentra inmersa en la era más oscura de su historia. Sin un atisbo de civilización, se considera que la raza humana ha llegado a su fin. Los supervivientes intentan retroceder en el tiempo utilizando el Nautilus, un viejo submarino con la capacidad de alterar las dimensiones temporales. Con la nave, pretenden volver a la época en la que se inició el proyecto Prometeo, que buscaba utilizar el núcleo del planeta como una fuente de energía, e impedir que se lleve a cabo.
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