Matrix Reloaded fue rodado simultáneamente con Matrix Revolutions, y fueron lanzados a los cines americanos con una diferencia de seis meses entre ellos. Las películas tardaron cuatro años en ser acabadas, entre pre-producción, grabaciones y post-producción.
La tardanza en la finalización de las secuencias fue debida principalmente, a la quiebra de algunas empresas de efectos especiales que habían sido contratadas para desarrollar ambas películas
Las grabaciones duraron más de 200 días.
La actriz Carrie-Anne Moss se torció la rodilla durante los entrenamientos realizados antes del incio de las grabaciones de las secuencias.
Keanu Reeves se fracturó el pie izquierdo durante los entrenamientos.
Precedido por Matrix (1999) y seguido por Matrix Revolutions (2003).