Debido al retraso en el inicio de las grabaciones, Ralph Fiennes y Kate Hudson renunciaron el proyecto. Kirsten Dunst aceptó participar, pero tuvo que abandonar porque fue contratada para actuar en Spiderman.
Inicialmente, La joven de la perla estaba dirigida por Mike Newell y tenía como estrellas a Ralph Fiennes y Kate Hudson. Durante la pre-producción, Newell dejó el proyecto y esto hizo que los productores también abandonasen la película. Con ambos abandonos, el inicio de las grabaciones se retrasó.
La película fue parcialmente rodada en los espacios de grabación de Pasaje Secreto (2002), que representaban Venecia y estaban localizados en Luxemburgo. Estos espacios fueron modificados para que la ciudad se pareciese a Delft.