El agente Cody Banks (Frankie Muniz) tiene una nueva y complicada misión. Un agente de la CIA, Víctor Díaz (Keith Allen), ha robado un dispositivo que se hace con el control de la mente humana y la única manera que tiene Cody de recuperarlo es infiltrándose en un instituto y hacerse pasar por un alumno más. Allí entablará amistad con Derek (Anthony Anderson), un chico alocado y chistoso, y se enamorará de la guapa Emily (Hannah Spearritt). Las apariencias engañan y la aparentemente inocente chica también guarda un secreto insólito.
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