Siglo XVII, España. La historia sigue a Hernán, un niño de 15 años, que en medio del horror de su época encuentra una fascinación increíble por una raíz con forma humana, a la que llama Mandrágora. Tras la muerte de sus padres a manos de las tropas del Conde Torresnegras, el joven decide huir adentrándose en un bosque repleto de criaturas y monstruos que no le harán nada fácil su paso por estas tierras.
En medio de este paraje habita La Bruja, una mujer que practica magia negra y que acogerá a Hernán y Mandrágora. Con la ayuda de un mercenario llamado Madariaga, juntos comenzarán una cruzada con el objetivo de acabar con el terror sembrado por Torresnegras.