100 jóvenes habían partido en dirección a la Tierra. Ahora solo quedan 48 y están separados; cada grupo de ellos luchando por sobrevivir. Una de las dirigentes de los mismos es Clarke, quién intenta entender que es lo que está ocurriendo de verdad en el planeta y, especialmente, con la nube ácida.
Por otra parte, los miembros del Arca buscan a todo superviviente posible que puedan ayudar; mientras los conflictos dentro del mismo organismo evolucionan. Todo esto con la siempre presente amenaza de los salvajes.