La tercera temporada de Blindspot comienza con un salto temporal: muestra a sus protagonistas 18 meses después de lo ocurrido al final de la segunda temporada. La relación entre Kurt y Jane se ha profundizado mientras han estado escondidos: disfrutan de su nueva vida de casados hasta que se ven obligados a volver a la acción. El equipo del FBI se reúne para combatir una nueva crisis. Aparecen nuevos tatuajes en el cuerpo de Jane que deben resolver. Roman quiere vengarse de Jane y amenaza con asesinar al equipo.