Está vivo. Desde que mató a su hermano, Dexter no ha vuelto a ser el mismo. Las sospechas de Doakes han aumentado tanto, que le sigue a todas partes y por eso, Dex no ha podido escoger a una nueva víctima. Ahora que su situación ha cambiado ¿podrá Dexter seguir siendo el mismo? Por otro lado, Deb intenta reponerse del trauma que supone haber sido la novia del asesino del hielo, y Rita, por su parte, cada vez confía menos en Paul.
S02E02 - Esperando exhalar
Esperando exhalar. 'El carnicero de la bahía', así es como llama la policía al asesino en serie responsable de numerosos cuerpos que han sido encontrados en una grieta en lo profundo del mar. Sin embargo, su nombre real es Dexter Morgan, aunque nadie lo sabe. Dex se enfrenta a una investigación, pero antes de preocuparse por eso, tiene asuntos más urgentes que resolver. Por otro lado, Rita no puede dejar de sentirse culpable por la muerte de Paul y al final decide hablar con Dexter.
S02E03 - Una mentira incómoda
Una mentira incómoda . Rita, que piensa que el extraño comportamiento de Dexter tiene que ver con las drogas, insiste en que acuda a un programa de rehabilitación o le dejará. Por otro lado, Frank Landy, el agente especial famoso por haber resuelto casos que parecían imposibles, es el encargado de encontrar al carnicero de la bahía y decide incluir a Debra en su equipo.
S02E04 - Te conozco
Te conozco. Masuka ha descubierto una pista que podría ser la clave para capturar al carnicero de la bahía. Mientras el cerco se va cerrando a su alrededor, Dex intenta seguir con el programa de rehabilitación a su manera, gracias a su tutora Lila. Además, la madre de Rita ha venido a visitarles y aunque Dexter no la desagrada cree que hay algo oscuro en él. Por otra parte, Debra intenta poner un poco de alegría en su vida y Doakes tiene un encontronazo con su pasado.
S02E05 - El oscuro defensor
El oscuro defensor. Dexter tendrá que superar algunas heridas del pasado. Mientras la policía analiza las algas halladas en el cuerpo de las víctimas del Asesino de la bahía, Dexter habla con Lila y le cuenta que su madre fue asesinada delante de él. Ella le convence para poner punto y final a su pasado. A la vez que intenta cerrar viejas heridas descubrirá nueva información sobre la muerte de su madre. Por su parte, la madre de Rita intenta convencer a su hija para que abandone a Dexter. Además, Debra comienza a desconfiar de su nuevo novio.
S02E06 - Dex, mentiras y cintas de video
Dex, mentiras y cintas de video . Un hombre asegura que el carnicero de la bahía intentó matarle, pero Dexter no conoce a la víctima de nada y además se da cuenta de que las cámaras de seguridad que instaló Landy en el puerto le han grabado limpiando los restos de sangre de su barco. O Dex hace algo pronto, o le descubrirán. En cuanto a su vida personal, desde que Lila apareció, la relación con Rita se ha complicado. Por su parte, Doakes vuelve a sospechar de Dexter desde que Debra le dijo que éste no estaba enganchado a ningún tipo de droga.
S02E07 - Esta noche, un bosque creció
Dexter decide tomar el control de la situación: manda una nota a la prensa como el carnicero de la bahía. De este modo intentará llevar la investigación a su terreno y controlar los movimientos de la policía.
También Dexter decide hacer algo en relación a Doakes para poder deshacerse de su acoso. Ya que cada vez su compañero de trabajo le crea más problemas. Pero las cosas siempre pueden cambiar en el último momento, a veces sin que nos demos cuenta...
Por su parte Debra descubre cuáles son sus verdaderos sentimientos hacia Landy.
S02E08 - Llega mañana
Landy decide poner en marcha una investigación interna a todos los policías de Miami, ya que sospecha que el carnicero de la Bahía podría ser uno de ellos o al menos que tener un nexo con la policía. Y es que cualquiera que conozca la forma de trabajar de la policía es sospechoso de ser el culpable. Esto también supondrá algunos cambios en el equipo y dirección de la investigación.
Y mientras la vida de Dexter se vuelve cada vez más caótica, vuelve a encontrarse con el asesino de su madre.
Por otra parte, la relación entre Debra y Landy se estrecha cada vez más, al mismo tiempo que la de Dexter y Lila.
S02E09 - Resistirse es inútil
Tras romper con Lila, Dexter comienza a reencontrarse con su antiguo yo, pero las cosas están bastante difíciles ya que Rita no parece aceptar sus disculpas y Lila no deja de acecharle. Y en el trabajo Doakes continúa acechándo a Dexer con su investigación particular, utilizando sus propios medios a pesar de haber dejado la policía.
Mientras Debra duda si hacer pública o no su relación con Landy, éste parece haber descubierto algo muy importante sobre el carnicero de la bahía ¿habrá descubierto a Dexter?
S02E10 - Algo pasa con Harry
Mientras Landy y su equipo siguen buscando a Doakes, Dexter no ha decidido aún que hacer con su rehén. Pero debe actuar pronto ya que Doakes intenta por todos los medios desconcertar a Dexter. Ahora con la intención de crearle más dudas sobre su padre adoptivo, vuelve a investigar sobre él descubriendo un nuevo y oscuro secreto.
Pero Dexter además tendrá que lidiar con Lila ya que ella no está dispuesta a dejarle marchar así como así.
S02E11 - Gire a la izquierda
Después de enterarse de que su padre se suicidó al ser consciente de lo que había creado, ahora el mundo de Dexter comienza a tambalearse.
Las conversaciones con Doakes le hacen plantearse una posible solución: entregarse. Pero tomar esta decisión conllevaría dejar preparadas muchas cosas.
Por otra parte Lila acusa a Ángel por violación y aunque todos creen que es inocente no pueden hacer demasiado, así que Debra decide investigar por su cuenta.
S02E12 - Invasión británica
Con el incendio de la cabaña y el hallazgo del cuerpo calcinado de Doakes, el caso del carnicero de la bahía queda prácticamente cerrado. Dexter decide abrazar su libertad y disfrutarla, crear su nuevo código, ser su propio maestro, pero ahora alguien conoce su secreto. ¿Será Lila su camino hacia la libertad o le guiará hacia la perdición?
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