En el siglo XXXI, la Tierra está bajo el control del emperador Bola de Billar IV, que odia a las personas con pelo y ha creado un ejército de Cazadores de Pelo para eliminar cualquier rastro de cabello en el mundo. Bobobo, un personaje con la habilidad única de comunicarse con su propio pelo, se convierte en el valiente "Liberta-cabelleras" para enfrentarse a esta amenaza.
Con la ayuda de aliados peculiares y valientes, Bobobo lucha contra las distintas divisiones del ejército del emperador, buscando que vuelva la libertad capilar y devolver la esperanza a un mundo alejado de su diversidad y esencia.
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