Tras derrotar, finalmente, a John "El Rojo" y cobrarse su tan ansiada venganza; Jane se encuentra en una situación nueva. El FBI, que había perseguido a Patrick toda la temporada anterior, decide contar con sus servicios.
Jane se incorpora a esta nueva agencia, mientras los miembros de su anterior agencia, el CBI, intentan escapar de un despiadado asesino. Además, el protagonista deberá intentar compatibilizar sus nuevas funciones como miembro del FBI con una vida personal que, por primera vez, Jane expresará.