Nathan es un niño de 11 años que encuentra una misteriosa máquina en medio del bosque. Ve una pequeña abertura por la que cabe algo parecido a una moneda así que no lo duda e introduce una moneda en ella. Así es cómo consigue el poder para ver a los Yo-Kai, unos seres invisibles cuyo único fin es crear problemas.
Sin embargo, esa no es la única sorpresa que le depara la máquina, pues junto con ese extraño poder, aparece Whisper, su Yo-Kai personal. Whisper tiene la misión de ayudar a Nathan a averiguar la razón del comportamiento de los otros Yo-Kai y a intentar que cambien de actitud para que se hagan sus amigos, una tarea nada fácil.
Partiendo de la idea original de Level-5 Inc., la comedia es una producción conjunta de Level-5, Inc., Dentsu Inc., y TV Tokyo Corporation.