La historia principalmente se desarrolla dentro de un grupo de terapia. Cuatro mujeres acuden a una terapeuta, llamada Eva, para compartir su vida sexual, vínculos afectivos y los conflictos que le pueden llegar a suponer. Laura, Sandra, Makiel y Carla cada una sumergida en su diferencia y orientación pero unidas en un grupo en el que hablan de sus problemas más inmediatos.
Muñecas se mueve en una trama LGTBI fuera de lo cánones heternormativos. No solo se basa en la orientación sexual de cada personaje, sino que explora más allá de sus vidas y profudiza en ellas. La serie de Flooxer está dirigida por Carlota Sayos e Inma Olmos, que aparece como actriz dentro de la ficción.