Tokyo Girl nos prenta a Aya que debe adaptarse a los nuevos valores después de mudarse a Tokio desde Akita, el pequeño pueblo donde vivía. Aya debe hacerse a la vida en la ciudad puesto que vive muchas situaciones difíciles y desafiantes para ella.
La serie recorre su vida desde los 18 hasta los 45 años. Aya comienza siendo una chica de los suburbios y sueña con poderse escapar, puesto que siempre ha pensado que todo habría sido mucho mejor si hubiese nacido en ciudades como Paris o Nueva York, aunque para ella, el haberse mudado a Tokio no ha sido una mala opción.
Aya sueña con vivir en un barrio rico, con tener un novio ideal y con poseer una vida digna de revista de moda. Pero no todo es tan fácil. La vida se complica para Aya y tendrá que aprender de todos los baches que le va poniendo por el camino. ¿Conseguirá Aya tener la vida que siempre ha soñado y conseguir todo lo que se ha propuesto siempre?