Brand New Animal nos adentra en pleno siglo XXI, donde, la existencia de humanos con forma de animal se hace cada día más evidente. Michiru, uno de ellos, vive una vida humana normal, hasta que un día, casi por arte de magia, se convirtió en un humano tanuki.
Esta huye y se refugia en la llamada 'Animal City' un área especial de la ciudad, que se creó hace diez años para que los humanos con forma de animal puedan vivir y convivir entre ellos. Aquí es donde conoce a Shirou, un lobo que tiene cierto odio a los humanos.
Michiru, con la ayuda de su nuevo amigo, comienza a aprender sobre las preocupaciones y el estilo de vida que llevan los animales humanos, mientras que intentan conocer las causas por las que de repente, Michiru, se convirtió en un animal humano.
Pero de forma inesperada, ambos se ven envueltos en un accidente que cambiará sus vidas para siempre. ¿Conseguirá averiguar qué es lo que le ha pasado a Michiru?
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