Basada en el videojuego homónimo, Corpse Party: Tortured Souls sigue la historia principal de cinco estudiantes que se ven transportados a un misterioso instituto habitado por numerosos fantasmas que quieren acabar con sus vidas.
Mayu Suzumoto está a punto de trasladarse a otra escuela. Antes de ello, todos sus amigos le realizan un encantamiento que les transporta al Heavenly Host. Separados unos de otros, tendrán que reunirse antes de que los espíritus acaben con ellos uno a uno.