La última de estas ideas es precisamente una, o bueno una versión, de la siguiente cinta de DC Comics en llegar a la gran pantalla: Batman v Superman. En 2002 el estudio se reunió con Wolfgang Petersen y con los guionistas Andrew Kevin Walker y Akiva Goldsman para llevar a cabo esta historia que contaría con Lex Luthor y El Joker como principales villanos.
Esta película comienza con la boda de Bruce Wayne tras cinco años retirado de la acción. Durante la luna de miel su mujer es asesinada y todo apunta a que El Joker es el culpable. Mientras tanto, Clark Kent está atravesando muchos problemas después de que Lois Lane le abandonase. Tras de servir de padrino en la boda de Bruce Wayne, el joven regresa a Smallville y retoma su relación con Lana Lang.
Durante el transcurso de la cinta, y pese a descubrir que Luthor y El Joker han unido sus fuerzas para destruirles, Batman y Superman luchan hasta que comprenden que los verdaderos enemigos no son ellos sino sus archienemigos, por lo que unirán sus fuerzas para acabar de una vez por todas con ellos. La película termina con un espléndido discurso de Bruce a El Joker en el que habla del enfrentamiento de sus dos identidades.
Finalmente, Warner decidió mantener las dos franquicias de superhéroes separadas y comenzó a trabajar en el Batman de Nolan y el Superman de Bryan Singer.
